Un estudio llevado a cabo por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas de EE UU (NIAID, en sus siglas en inglés) y que se ha publicado en Nature Communications ha revelado cómo podrían generarse algunas variantes del SARS-CoV-2, virus causante de la COVID-19. Los investigadores examinaron los genes del SARS-CoV-2 y su evolución temporal en personas con y sin el VIH que tenían COVID-19. Deforma destacable, hallaron que las personas con infección por el VIH avanzada, con bajos niveles de CD4, tenían diversas variantes del SARS-CoV-2 en su organismo, mientras que aquellas sin el VIH o con infección por el VIH controlada tenían únicamente una variante principal del SARS-CoV-2.
Al igual que otros virus, el SARS-CoV-2 evoluciona rápidamente. Cuando el virus entra al cuerpo, durante su proceso de replicación (reproducción) el material genético del virus puede cambiar o mutar, generando nuevas variantes virales. Las variantes de preocupación (VOC, en sus siglas en inglés) son variantes virales con características que las hacen más peligrosas, ya sea porque causan una enfermedad más grave, encuentran nuevas formas de evadir el sistema inmunitario o se propagan más fácilmente.
Ha sido difícil determinar cómo surgen nuevas VOC del SARS-CoV-2. Algunos estudios sugieren que cuando las personas inmunodeprimidas adquieren el SARS-CoV-2, las diferentes características de cada persona crean condiciones que promueven nuevas variantes al permitir que el virus se mantenga activo y replicándose (y, por tanto, mutando) por tener una respuesta inmunitaria debilitada.
Para examinar cómo pueden surgir las VOC, los autores del presente estudio contaron con la participación de una cohorte de personas con COVID-19 de Sudáfrica. El grupo de estudio incluyó a 47 personas con y sin el VIH, 12 de las cuales tenían infección por el VIH avanzada, definida como tener unos niveles de CD4 inferiores a 200 células/mm³.
El equipo de investigación analizó la evolución del SARS-CoV-2 en los participantes utilizando una técnica llamada amplificación y secuenciación de genomas únicos de alto rendimiento (HT-SGS, en sus siglas en inglés). Ello les permitió obtener información genética de miles de partículas víricas individuales de SARS-CoV-2 por muestra, proporcionando información detallada sobre las diferentes mutaciones presentes en cada participante en un momento dado y permitiendo un análisis de la evolución viral con un nivel de detalle previamente no alcanzado.
Los investigadores analizaron el gen de la proteína S del SARS-CoV-2, que el virus utiliza para entrar en las células, para ver qué variantes estaban presentes a lo largo del curso de la COVID-19 y encontraron diferencias significativas en las variantes del SARS-CoV-2 de los participantes del estudio.
Los autores del estudio hallaron que las personas con infección por el VIH avanzada que tenían COVID-19 presentaban múltiples variantes del SARS-CoV-2 y la población de virus en cada una de estas personas se volvía más diversa y evolucionaba a lo largo de la infección. La mediana del número de variantes del SARS-CoV-2 en personas con infección por el VIH avanzada fue de 47, y algunas de ellas presentaban más de 100 variantes detectables a lo largo de la infección. En personas sin el VIH o con infección por el VIH controlada (con niveles de CD4 superiores a 200 células/mm³), la población de virus en cada una de ellas era generalmente uniforme. En la mayoría de estas personas solo se detectó una variante principal del SARS-CoV-2, con poca evidencia de que el virus hubiera evolucionado durante la infección.
Los resultados del presente estudio muestran cómo el SARS-CoV-2 puede generar nuevas variantes en personas con infección por el VIH avanzada (algo extrapolable a otras personas en condición de inmunosupresión por causas diferentes a la infección por el VIH) y proporcionan una mayor comprensión de cómo surgen y se adaptan nuevas variantes en personas con sistemas inmunológicos comprometidos.
Fuente: Elaboración propia (gTt-VIH)
Referencia: Ko, SH, Radecki, P, et al. Rapid intra-host diversification and evolution of SARS-CoV-2 in advanced HIV infection. Nature Communications. DOI: 10.1038/s41467-024-51539-8 (2024).
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